SIGLEC5 — Википедия

SIGLEC5
SIGLEC5
Доступные структуры
Доступные структуры
PDB	Поиск по базе UniProt: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB
Список идентификаторов PDB
	2ZG1, 2ZG2, 2ZG3
Идентификаторы
Псевдонимы	SIGLEC5, CD170, CD33L2, OB-BP2, OBBP2, SIGLEC-5, sialic acid binding Ig like lectin 5
Внешние ID	OMIM: 604200 HomoloGene: 55783 GeneCards: SIGLEC5
Расположение гена (человек)
Расположение гена (человек)
Хр.	19-я хромосома человека
Конец	51,630,401 bp
Паттерн экспрессии РНК
Паттерн экспрессии РНК
	Наибольшая экспрессия в
	upper lobe of left lung;
	н/д
	Дополнительные справочные данные
	Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Генная онтология
Молекулярная функция	связывание углеводов; связывание с белками плазмы;
Компонент клетки	часть мембраны; мембрана; клеточная мембрана; secretory granule membrane; tertiary granule membrane; ficolin-1-rich granule membrane;
Биологический процесс	агрегация клеток; neutrophil degranulation;
	Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
Ортологи
	8778
	н/д
	ENSG00000268500
	н/д
	O15389
	н/д
	NM_003830; NM_001384708; NM_001384709
	н/д
	NP_003821
	н/д
	Информация в Викиданных
Смотреть (человек)

SIGLEC5 (Sialic acid-binding Ig-like lectin 5; Ig-подобный лектин 5, связывающий сиаловую кислоту; CD170) — белок, молекула клеточной адгезии. Взаимодействует с сиаловыми кислотами. Продукт гена человека SIGLEC1^[3]^[4].

Локализация[править | править код]

Экспрессирован на моноцитах и нейтрофилах. Особенно высокая экспрессия обнаружена на клетках периферической крови, селезёнки и костного мозга, присутствует также на миелоидных клетках в лимфатических узлах, лёгких, аппендиксе, плаценте, поджелудочной железе и тимусе. SIGLEC1 отсутствует на лейкемических клетках, представляющих ранние этапы миеломоноцитической дифференцировки.

Литература[править | править код]

Maruyama K., Sugano S. Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides (англ.) // Gene (англ.) (рус. : journal. — Elsevier, 1994. — Vol. 138, no. 1—2. — P. 171—174. — doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. — PMID 8125298.
Suzuki Y., Yoshitomo-Nakagawa K., Maruyama K., etal. Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library (англ.) // Gene (англ.) (рус. : journal. — Elsevier, 1997. — Vol. 200, no. 1—2. — P. 149—156. — doi:10.1016/S0378-1119(97)00411-3. — PMID 9373149.
Cornish A. L., Freeman S., Forbes G., etal. Characterization of siglec-5, a novel glycoprotein expressed on myeloid cells related to CD33 (англ.) // Blood (англ.) (рус. : journal. — American Society of Hematology (англ.) (рус., 1998. — Vol. 92, no. 6. — P. 2123—2132. — PMID 9731071.
Patel N., Brinkman-Van der Linden E. C., Altmann S. W., etal. OB-BP1/Siglec-6. A leptin- and sialic acid-binding protein of the immunoglobulin superfamily (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1999. — Vol. 274, no. 32. — P. 22729—22738. — doi:10.1074/jbc.274.32.22729. — PMID 10428856.
Yousef G. M., Ordon M. H., Foussias G., Diamandis E. P. Genomic organization of the siglec gene locus on chromosome 19q13.4 and cloning of two new siglec pseudogenes (англ.) // Gene (англ.) (рус. : journal. — Elsevier, 2002. — Vol. 286, no. 2. — P. 259—270. — doi:10.1016/S0378-1119(02)00432-8. — PMID 11943481.
Strausberg R. L., Feingold E. A., Grouse L. H., etal. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
Erickson-Miller C. L., Freeman S. D., Hopson C. B., etal. Characterization of Siglec-5 (CD170) expression and functional activity of anti-Siglec-5 antibodies on human phagocytes (англ.) // Exp. Hematol. (англ.) (рус. : journal. — 2003. — Vol. 31, no. 5. — P. 382—388. — doi:10.1016/S0301-472X(03)00046-8. — PMID 12763136.
Grimwood J., Gordon L. A., Olsen A., etal. The DNA sequence and biology of human chromosome 19 (англ.) // Nature : journal. — 2004. — Vol. 428, no. 6982. — P. 529—535. — doi:10.1038/nature02399. — PMID 15057824.
Gerhard D. S., Wagner L., Feingold E. A., etal. The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC) (англ.) // Genome Res. (англ.) (рус. : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
Avril T., Freeman S. D., Attrill H., etal. Siglec-5 (CD170) can mediate inhibitory signaling in the absence of immunoreceptor tyrosine-based inhibitory motif phosphorylation (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2005. — Vol. 280, no. 20. — P. 19843—19851. — doi:10.1074/jbc.M502041200. — PMID 15769739.
Rual J. F., Venkatesan K., Hao T., etal. Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network (англ.) // Nature : journal. — 2005. — Vol. 437, no. 7062. — P. 1173—1178. — doi:10.1038/nature04209. — PMID 16189514.
Rapoport E. M., Pazynina G. V., Sablina M. A., etal. Probing sialic acid binding Ig-like lectins (siglecs) with sulfated oligosaccharides (англ.) // Biochemistry Mosc. (англ.) (рус. : journal. — 2006. — Vol. 71, no. 5. — P. 496—504. — doi:10.1134/S0006297906050051. — PMID 16732727.
Biedermann B., Gil D., Bowen D. T., Crocker P. R. Analysis of the CD33-related siglec family reveals that Siglec-9 is an endocytic receptor expressed on subsets of acute myeloid leukemia cells and absent from normal hematopoietic progenitors (англ.) // Leuk. Res. (англ.) (рус. : journal. — 2007. — Vol. 31, no. 2. — P. 211—220. — doi:10.1016/j.leukres.2006.05.026. — PMID 16828866.
Angata T., Hayakawa T., Yamanaka M., etal. Discovery of Siglec-14, a novel sialic acid receptor undergoing concerted evolution with Siglec-5 in primates (англ.) // The FASEB Journal (англ.) (рус. : journal. — Federation of American Societies for Experimental Biology (англ.) (рус., 2006. — Vol. 20, no. 12. — P. 1964—1973. — doi:10.1096/fj.06-5800com. — PMID 17012248.
Zhuravleva M. A., Trandem K., Sun P. D. STRUCTURAL IMPLICATIONS OF SIGLEC-5 MEDIATED SIALO-GLYCAN RECOGNITION (нем.) // J. Mol. Biol. (англ.) (рус. : magazin. — 2007. — Bd. 375, Nr. 2. — S. 437—447. — doi:10.1016/j.jmb.2007.10.009. — PMID 18022638. — PMC 2245879.

Примечания[править | править код]

↑ ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000268500 - Ensembl, May 2017
↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
↑ Kim H. S. Assignment of the human OB binding protein-2 gene (CD33L2) to chromosome 19q13.3 by radiation hybrid mapping (англ.) // Cytogenetic and Genome Research (англ.) (рус. : journal. — Karger Publishers (англ.) (рус., 1999. — June (vol. 84, no. 1—2). — P. 96. — doi:10.1159/000015227. — PMID 10343116.
↑ Entrez Gene: SIGLEC5 sialic acid binding Ig-like lectin 5 (неопр.).

[refGRCh38EnsemblENSG00000268500-1] ¹ ² ³ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000268500 - Ensembl, May 2017

[2] Ссылка на публикацию человека на PubMed: (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid10343116-3] Kim H. S. Assignment of the human OB binding protein-2 gene (CD33L2) to chromosome 19q13.3 by radiation hybrid mapping (англ.) // Cytogenetic and Genome Research (англ.) (рус. : journal. — Karger Publishers (англ.) (рус., 1999. — June (vol. 84, no. 1—2). — P. 96. — doi:10.1159/000015227. — PMID 10343116.

[entrez-4] Entrez Gene: SIGLEC5 sialic acid binding Ig-like lectin 5 (неопр.).

[1]

[2]

[3]

[4]

Белки: Кластеры дифференцировки
1-50	CD1 (a-c, 1A, 1D, 1E) CD2 CD3 (γ, δ, ε) CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 (a) CD9 CD10 CD11 (a, b, c, d) CD13 CD14 CD15 CD16 (A, B) CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 (A, B) CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 (a, b, c, d) CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 (a, b, c, d, e, f) CD50
51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 (E, L, P) CD63 CD64 (A, B, C) CD66 (a, b, c, d, e, f) CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 (a, b) CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 (a, d, e, h, j, k) CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 (a, b) CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 (a, b) CD121 (a, b) CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 (a, b, c) CD157 CD158 (a, d, e, i, k) CD159 (a, c) CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 (a, b) CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 (a, b, g) CD174 CD177 CD178 CD179 (a, b) CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 (a, b) CD212 CD213a (1, 2) CD217 CD218 (a, b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 (a, b) CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249
251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD270 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD319 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350
351-400	CD351 CD352 CD353 CD354 CD355 CD357 CD358 CD360 CD361 CD362 CD363 CD364 CD365 CD366 CD367 CD368 CD369 CD370 CD371