Cet article recense les sites Natura 2000 de l'Aube, en France.
L'Aube compte 22 sites classés Natura 2000. 17 bénéficient d'un classement comme site d'intérêt communautaire (SIC), 5 comme zone de protection spéciale (ZPS).
| Site | Type | Superficie (ha) | Fiche | Coordonnées | Photo |
| Bois d'Humégnil-Épothémont | SIC | +00417, | FR2100310 | 48° 24′ 12″ nord, 4° 39′ 29″ est | |
| Camp militaire du bois d'Ajou | SIC | +00267, | FR2100311 | 48° 24′ 44″ nord, 4° 34′ 17″ est | |
| Carrières souterraines d'Arsonval | SIC | +00345, | FR2100339 | 48° 16′ 59″ nord, 4° 37′ 29″ est | |
| Étang de la Horre | SIC | +00725, | FR2100332 | 48° 30′ 00″ nord, 4° 39′ 17″ est | |
| Forêt d'Orient | SIC | +06 135, | FR2100305 | 48° 17′ 53″ nord, 4° 25′ 38″ est | |
| Forêts et clairières des Bas-Bois | SIC | +02 846, | FR2100309 | 48° 18′ 49″ nord, 4° 16′ 51″ est | |
| Garenne de la Perthe | SIC | +00637, | FR2100308 | 48° 36′ 56″ nord, 3° 58′ 33″ est | |
| Marais de la Superbe | SIC | +00276, | FR2100285 | 48° 35′ 57″ nord, 3° 54′ 22″ est | |
| Marais de la Vanne à Villemaur | SIC | +00090, | FR2100282 | 48° 15′ 23″ nord, 3° 45′ 01″ est | |
| Marais de Villechetif | SIC | +00139, | FR2100281 | 48° 18′ 41″ nord, 4° 07′ 33″ est | |
| Pelouse des Brebis à Brienne-la-Vieille | SIC | +00040, | FR2100253 | 48° 21′ 49″ nord, 4° 31′ 36″ est | |
| Pelouses et forêts du Barsequanais | SIC | +00303, | FR2100251 | 47° 58′ 23″ nord, 4° 31′ 51″ est | |
| Prairies et bois alluviaux de la basse vallée alluviale de l'Aube | SIC | +00742, | FR2100297 | 48° 33′ 16″ nord, 3° 59′ 50″ est | |
| Prairies de Courteranges | SIC | +00041, | FR2100290 | 48° 16′ 32″ nord, 4° 13′ 54″ est | |
| Prairies de la Voire et de l'Héronne | SIC | +01 088, | FR2100295 | 48° 28′ 14″ nord, 4° 34′ 43″ est | |
| Prairies, marais et bois alluviaux de la Bassée | SIC | +00841, | FR2100296 | 48° 32′ 20″ nord, 3° 41′ 45″ est | |
| Savart du camp militaire de Mailly-le-Camp | SIC | +00536, | FR2100257 | 48° 35′ 11″ nord, 4° 19′ 11″ est | |
| Barrois et forêt de Clairvaux | ZPS | +41 156, | FR2112010 | 48° 08′ 05″ nord, 4° 43′ 45″ est | |
| Étang de la Horre | ZPS | +01 452, | FR2110091 | 48° 30′ 00″ nord, 4° 40′ 00″ est | |
| Herbages et cultures des vallées de la Voire, de l'Héronne et de la Laines | ZPS | +02 274, | FR2112001 | 48° 28′ 14″ nord, 4° 34′ 43″ est | |
| Lacs de la forêt d'Orient (d'Orient, Amance et du Temple) | ZPS | +23 575, | FR2110001 | 48° 16′ 00″ nord, 4° 20′ 00″ est |  |
| Marigny, Superbe, vallée de l'Aube | ZPS | +04 527, | FR2112012 | 48° 36′ 05″ nord, 3° 58′ 48″ est | |
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