土壤红杆菌目（学名：Solirubrobacterales）是嗜热油菌纲的一目放线菌。 本目包括以下科： 长白山菌科 Baekduiaceae An et al. 2019 长白山菌属 Baekduia An et al. 2019 白色长白山菌 Baekduia alba Vieira et al...

微小杆菌属（学名：Exiguobacterium）為核衣细菌目微小杆菌科 的一属革兰氏阳性菌。从土豆加工废水中分离到。此属的模式种为金橙黄微小杆菌(Exiguobacterium aurantiacum)。 本属包括以下物种： 乙酰微小杆菌 Exiguobacterium acetylicum (Levine...

黏球菌目（学名：Myxococcales）為δ-变形菌纲的一目细菌。此目细菌的模式属为原囊黏菌属（Myxococcus）。 本目包括以下科： 厌氧黏杆菌科 Anaeromyxobacteraceae Yamamoto et al. 2014 厌氧黏杆菌属 Anaeromyxobacter Sanford...

土壤杆菌属（学名：Edaphobacter）为酸杆菌科的一个属。 本属包括以下物种： Edaphobacter acidisoli Edaphobacter aggregans 鼎湖山土壤杆状菌 Edaphobacter dinghuensis ，采自广东省鼎湖山生物圈保护区 Edaphobacter...

土壤芽胞杆菌属（学名：Solibacillus）为动球菌科的一属细菌。 本属包括以下物种： Solibacillus cecembensis (Reddy et al. 2008) Gupta and Patel 2020 鸟粪土壤芽胞杆菌 Solibacillus faecavium Pallen...

酸桿菌門（Acidobacteria）是新近被分出的一門細菌。它們是嗜酸菌。現在對它們研究還很少，但它們在生態系統中具有重要作用，比如土壤中。 酸桿菌目(Acidobacteriales) 酸桿菌科(Acidobacteriaceae) 酸桿菌屬(Acidobacterium) (Edaphobacter)...

农杆菌属（学名：Agrobacterium），又称土壤杆菌属，是革兰氏阴性菌的一个属，常通过水平基因转移导致植物根瘤的产生，该属以向植物导入DNA的能力而闻名，因此农杆菌属也是用于改良植物的重要工具。其中模式种根瘤农杆菌（Agrobacterium tumefaciens）是本属中最常研究的种系。...

盐碱杆菌属（学名：Natronobacterium）也称嗜盐碱杆菌属，為无色嗜盐菌目无色嗜盐菌科的一属革兰氏阴性菌。生活在碳酸型盐湖、碱性盐场和碳酸盐土壤等中。此属的模式种为格氏盐碱杆菌(Natronobacterium gregoryi)。 本属包括以下物种： 格氏嗜盐碱杆菌 Natronobacterium...

腸桿菌屬（学名：Enterobacter）是一種革蘭氏染色陰性、兼性厭氧及呈棒狀的无芽孢形成細菌，屬於腸桿菌目腸桿菌科。肠杆菌属存在于动物肠道、粪便、污水、土壤、植物，可作为食品或水体粪便污染指示菌。 大部分腸桿菌屬都具有三種特徵：葡萄糖發酵作用（glucose fermentation）陽性、細胞色素氧化酶（cytochrome...

林杆菌属（学名：Alsobacter ）为根瘤菌目林杆菌科的一属细菌。 本属包括以下物种： Alsobacter metallidurans Bao et al. 2014 Alsobacter ponti Deng et al. 2024 土壤林杆菌 Alsobacter soli Sun et...

硝化杆菌科（学名：Nitrobacteraceae）為生丝微菌目的一科细菌。此科的模式属为硝化杆菌属（Nitrobacter）。 本科包括以下属： 阿菲波菌属 Afipia Brenner et al. 1992 土壤单胞菌属 Agromonas Ohta and Hattori 1985 芽生杆菌属...