分子系统发生学（Molecular phylogenetics）是分析遗传分子差异（主要是DNA序列）的系统发生学的一个分支，以获得有机体进化关系的信息。分子系统发生学分析的结果在系统发生树(phylogenetic tree)中表达。分子系统发生学是分子系統分類學的一个方面，更广泛的术语还包括在生物分类学和生物地理学中使用分子数据。...

化石形态学和解剖学特征的比较和研究， 现存生物的形态学，解剖学和生理学特征的比较， 生物，特别是现存生物的个体发生研究， DNA分析，例如测序和分子系统发生学方法。 通过这些数据，人们就可以为生物建立一棵系統發生樹（演化树），其中描述了各个物种之间可能有的亲缘关系。 系统发生学研究的最大困难是，系统发生学...

vivo）或是體外（in vitro）免疫系統構成分子的物理、化學、生理性質。免疫學也已被廣泛應用於如下的領域上。 主要的免疫系統包括胸腺、脾臟、骨髓、淋巴管、淋巴節和二次淋巴組織（如扁桃腺或是增殖腺）、皮膚。在免疫系統在組織學的檢查上，主要的器官、胸腺以及脾臟只能在死後解剖上得以了...

分子建模（英語：Molecular modelling）或稱分子模擬，是指利用理論方法與計算技術，模擬出化學分子的外觀或性質，屬於計算化學與計算生物學領域的研究對象。並且是化學與生物學上，如結構生物學等學門所應用的研究方法。 分子建模中最理想化即为量子力学（quantum mechanics，QM），包括从头算（ab...

分子演化是指細胞分子（如DNA、RNA和蛋白質）的序列組成在不同世代間發生改變，或是指研究此現象的學門。此研究領域主要使用演化生物學和族群遺傳學的原理來解釋分子演化的規律，主要的研究主題有點突變的發生率和影響、中性漂變和自然選擇的相對重要性、新基因的起源、複雜性狀的可遺傳性、物種形成的遺傳基礎、發育...

生物系统工程學（Biological systems engineering），是生物工程學的一個分支。 生物系统工程學可简述为生物系统论、仿生工程与基因工程的整合，涉及医疗诊断、药物筛选、遗传育种与生物制药等产业，包括了转基因生物反应器、分子与细胞生物计算机等技术开发。系統生物工程是系統...

分子生態學是利用进化生物学理论，采用分子生物学和基因组学的实验方法和技术手段、统计学和数学的分析方法，通过计算机科学的技术和算法，旁及地学、古气候学等, 研究物种和种群的遗传变异及表观遗传变异、遗传谱系, 探讨生物多样性演化、生物地理演化、物种分化、生态适应等的生态学和进化生物学机制。...

原子分子与光物理學是研究物质之间，或光与物质的相互作用， 其研究尺度約一至數個原子，能量尺度約幾個電子伏特。 这三个物理学的领域研究通常是紧密关联的。 原子分子与光物理學使用经典物理学、半经典物理学、与量子物理学的研究方法。 通常情況下，此理論的應用包含原子发射或吸收光子、激发态原子和分子...

生物組學（英语：Biomics）（Biomics）。 生物群系的系統分析。 计算机科学，信息学和统计学的其他方面也用于系统生物学。 生物学主题 分子与细胞生物学主题 信息技术主题 系统生物学置标语言（SBML） 人工生命 生物医学控制论 计算机仿真 基因调节网络 系统生态学 系統藥理學 系统生物学家 合成生物学 调节子 Bu, Zimei;...

分子动力学是一套分子模拟方法，该方法主要是依靠计算机来模拟分子、原子体系的运动，是一种多体模拟方法。通过对分子、原子在一定时间内运动状态的模拟，从而以动态观点考察系统随时间演化的行为。通常，分子、原子的轨迹是通过数值求解牛顿运动方程得到，势能（或其对笛卡尔坐标的一阶偏导数，即力）通常可以由分子...

分子层次探讨了自组织系统。 著名科学家钱学森提出系统科学的层次模型，其详细分类如下： 第一层：系统观。次是系统学，它是系统科学的基本理论。这是系统的哲学和方法论的观点，是系统科学通向马克思主义哲学的桥梁和中介； 第二层：技术科学层次。有运筹学、系统理论、控制论、信息论等，是系统工程的直接理论；...